Molecular profiling and risk stratification of Acute Myeloid Leukemia patients in Kuwait.

Project: Applied ResearchApplied Research 2022 Cycle 2

Project Details

Abstract Arabic

سرطان الدم النخاعي الحاد (AML) يتميز بالتوسع النسيلي لمولدات النخاع الشوكي في النخاع العظمي. إنها أكثر أنواع اللوكيميا الحادة شيوعًا التي تصيب البالغين ، ويزيد حدوثها مع تقدم العمر. منظمة الصحة العالمية (WHO) 2016 تصنف AML ، على أساس التشكل ، البيانات الجزيئية ، النمط المناعي والعرض السريري. يعتبر AML مرضًا معقدًا وديناميكيًا مشتقًا من طفرات السائق المكتسبة المتعددة. يعد الفحص الجزيئي لـ AML مهمًا في اتخاذ القرارات الطبقية والمخاطر. إن جينات مثل الجين التيروزين كيناز 3 (FLT3) الذي يشبه FMS ، والجين Nucleophosmin 1 (NPM1) ، وطفرة α المرتبطة بـ CCAAT / المُحسِّن (CEBPA) والعديد من النقاط الساخنة / الجينات الأخرى لها قيمة تشخيصية عالية. سيتم إجراء التحليل التحولي التمهيدي التقليدي من خلال تحليل الأجزاء يتطلب تحديد العلامات الحيوية في Massive Biomarker تقنية عالية الدقة لأنها مهمة في تصنيف وتقسيم المرضى. التسلسل من الجيل التالي (NGS) عبارة عن تقنية عالية الإنتاجية تسمح بالتسلسل المتوازي الهائل للنقاط الساخنة والجينات المتعددة. ومع ذلك ، قد يكون الأمر مكلفًا نسبيًا لتسلسل جميع المواقع ذات الصلة سريريًا ؛ وبالتالي ، فإننا نقترح بموجب هذا إنشاء منصة معيارية عن طريق استخدام مجسات انعكاس جزيئي منفرد جزيء واحد (smMIPS) للتسلسل الضخم. سيتم تقييم النتائج التي تم الحصول عليها بواسطة هذه التقنية باستخدام الألواح الجاهزة المتوفرة في السوق والتي تم التحقق من صحتها بتحليل منحنى الانصهار عالي الدقة (PCM) في الوقت الحقيقي. سيتم جمع التقارير الوراثية الخلوية من مركز الكويت لمكافحة السرطان لكل مريض. سيتم تصنيف مرضى AML في الكويت وفقًا لمعايير منظمة الصحة العالمية وسيتم تقسيم المخاطر حسب توصيات شبكة اللوكيميا الأوروبية. سيتم أيضًا احتساب إحصاءات البقاء وفقًا للبيانات التي تم الحصول عليها.

Abstract English

Acute myeloid leukemia (AML) is characterized by clonal expansion of myeloid progenitors in the bone marrow. It is the most common acute leukemia affecting adults, and its incidence increases with age. World health organization (WHO) 2016 classifies AML based on morphology, molecular data, immunophenotype and clinical presentation. Multiple driver mutations characterize AML, contributing to its complexity and dynamicity. Molecular screening of AML is essential in risk stratification and treatment decisions. Genes, such as Nucleophosmin 1 (NPM1), CCAAT/enhancer-binding protein α mutation (CEBPA), and FMS-like tyrosine kinase 3 (FLT3), among other hotspots, hold high prognostic value. The conventional preliminary mutational analysis will be conducted by fragment analysis Massive Biomarker profiling requires high thorough-put technology as it is critical in classifying and stratification of the patients. Next-generation Sequencing (NGS) is such high-throughput technology that allows massive parallel sequencing of multiple hotspots and genes. However, it could be relatively expensive to sequence all the clinically relevant sites; hence we hereby propose to establish a modular platform by employing single-molecule molecular inversion probes (smMIPS) for massive sequencing. The results obtained by the technique will be cross evaluated using readymade panels available in the market further validated by Real-time PCR High Resolution Melting (HRM) curve analysis. The cytogenetic reports will be collected from Kuwait Cancer Control Center for each patient. Classification of the AML patients in Kuwait will be done in accordance to the WHO standards and risk will be stratified by European Leukemia Network recommendations. Survival statistics will also be calculated based on the data obtained.
Short titleMolecular profiling and risk stratification of Acute Myeloid Leukemia patients in Kuwait.
StatusActive
Effective start/end date9/05/22 → …

Fingerprint

Explore the research topics touched on by this project. These labels are generated based on the underlying awards/grants. Together they form a unique fingerprint.