Genetic Study of Early Onset Breast Cancer in Kuwait

يمثل سرطان الثدي العائلي من 5 إلى 10٪ من جميع حالات سرطان الثدي. وتعتبر الطفرات في اثنين من الجينات المعروفة بBRCA1 و BRCA2 عالية الحساسية سببا مهما 16-40٪ من مجمل سرطان الثدي العائلي بينما تفسر الجينات أخرى كعالية، ومتوسطة ومنخفضة التعرض قد تصل إلى أكثر من 20٪ فقط من أسباب سرطان الثدي.
في بحثنا، تم اختبار 120 مريضة لديهن تاريخ عائلي لسرطان الثدي وقد استخدمت تقنية WHOLE EXOME SEQUENCING تليها تقنية سانجر للتحقق من صحة النتائج. والنتيجة، تم العثور على 15 طفرة مسببة للأمراض. حيث تم اكتشاف 25 طفرة في 12جينات مختلفة وهي: BRCA1, BRCA2, TP53, SLX4, STK11, MSH2, ATM, FANCM, MLH1, POLH, PRF1 and CDH1. وأثبتت ابحاثنا ان انتشار طفرات BRCA1 و BRCA2 الضارة في الشرق الأوسط تصل الى (15.5%) والتي تعتبر أقل من تلك التي ذكرت في التقارير الغربية.
ومن هنا يعتبر تطبيق( الجيل المقبل التسلسلي) WHOLE EXOME SEQUENCING على سرطان الثدي هو الاول في منطقة الشرق الأوسط، والذي أكدت نتائجه أن معدل انتشار الطفرات فيه بشكل عام يساوي 40% وهو ما يبرر الحاجة الملحة لتطبيق WHOLE EXOME SEQUENCING لتحديد الجينات المسؤولة عن سرطان الثدي العائلي في بلداننا.

Familial breast cancer (BC) represents 5 to 10 % of all BC cases. Mutations in two high susceptibility BRCA1 and BRCA2 genes explain 16–40% of familial BC, while other high, moderate and low susceptibility genes explain up to 20 % more of BC families. The Middle East, including Kuwait, reported prevalence of BRCA1 and BRCA2 deleterious mutations (15.5%) were lower than those reported in the Western literature. In the presented study, 120 patients with a reported family history of BC were tested using Whole Exome Sequencing (WES) technique followed by Sanger sequencing validation. Consequently, 25 pathogenic mutations were found in this study. These mutations were found in 12 different genes; BRCA1, BRCA2, TP53, SLX4, STK11, MSH2, ATM, POLH, PRF1, FANCM, MLH1 and CDH1.

In this first application of WES on BC in the Middle East, we showed that the overall mutation prevalence is equal to 40%, justifying the urgent need of the WES to identify genes responsible for familial BC in our population.