Identification and Characterization of Novel Corona and Associated Respiratory Viruses in Aerosols

ينتشر جائحة فيروس كورونا الجديد في العالم بمعدل غير مسبوق. وهو فيروس تنفسي يسبب اعراض مثل الالتهاب الرئوي التي تؤدي في نهاية المطاف إلى وفاة المرضى الذين يعانون من نقص المناعة. . وقد سجل مؤخراً أن هذا الفيروس القاتل يحمل كذلك عن طريق الهباء الجوي. ويشهد على حالات الإصابة المشتركة مع مرض COVID-19 تفاقم عدوى السارس CoV2 بسبب الطفرات المحتملة وأحداث إعادة تركيب الحمض النووي مع الفيروسات التاجية البشرية الأخرى. لا توجد حاليا اي بيانات متاحة عن الفيروسات الموجودة في الهباء الجوي في الكويت.و كشفت نتائجنا من مشروع قد تم الانتهاء منه مؤخرًا عن وجود بكتيريا وفطريات في الأجزاء القابله للاستنشاق من ذرات الغبار المنقولة بواسطة الهواء في الكويت وذلك باستخدام أحدث ما توصلت إليه التكنولوجيا لتقدير التجمعات الفيروسية في العينات البيئية و هي تكنولوجيا التسلسل molecular لذلك ، نقترح إجراء هذه الدراسة لتحديد فيروس كورونا الجديد وفيروسات الجهاز التنفسي المرتبطة به في الجزء المستنشق من الهواء الذي سوف يتم جمعه من المناطق عالية الخطورة في الكويت بهدف المراقبة المبكرة وإدارة المخاطر. كما نهدف إلى إجراء التنميط الموسمي لـ SARS CoV2 والأنواع الأخرى المتعايش معها من أجل وضع إرشادات الإنذار المبكر ضد الأوبئة في المستقبل.

The role of airborne particles in the spread of SARS-CoV-2 remains mostly unexplored. Within the aerosol, the novel coronavirus is speculated to be able to survive for extended periods and its interaction with other viral communities can cause additional virulence and infectivity. In the present project, the project team developed a novel protocol that is safe and efficient in capturing and lysing the viral aerosols. This protocol was tested at three major hospitals in Kuwait where COVID-19 patients are treated, that is, Sheikh Jaber, Mubarak Al Kabeer, and Amiri hospitals. The robust qPCR and NGS technology identified the presence of SARS-CoV-2 in indoor environments of Mubarak Al Kabeer (41 copies m-3), Sheikh Jaber Hospital (21 copies m-3) and Amiri hospitals (42 copies m-3). Three other coronaviruses, namely HKU1, NL63, CoV229E were also detected in the COVID isolation area of Mubarak Al Kabeer Hospital. The team observed that the aerosols collected were also rich in Adenoviruses, RSV, Rhinoviruses, FluB and enteroviruses. Bacterial and fungal populations co-existed with the viral communities. Among the bacterial species, the presence of M. pneumonia, S. pneumonia, and, H. influenza was recorded. The team’s results suggest the airborne spread of SARS CoV2 in enclosed spaces. Existing interventions such as social distancing, face masks, hand hygiene, surface sanitization, and avoidance of crowded indoor spaces are fair enough to restrict the airborne spread of SARS-CoV-2 in enclosed areas. In addition, increased ventilation and open space can desirably limit the concentration of SARS CoV2 in aerosols.