Immunophenotyping and Antiviral Gene Expression of Innate Immune Response during SARS-Cov-2 Infection

سبب وباء مرض التاجي المستمر لعام 2019 ) COVID-19 ( هو فيروس التاجي التنفسي الحاد 2SARS-CoV- .(SARS-CoV-2 ( هو عضو في جنس بيتاكورونافيروس الذي يشمل أيضا متلازمة الالتهاب الرئوي الحاد ) SARS ( ومتلازمة الشرق الأوسط التنفسية ) MERS (. بينما تمت دراسة SARS-CoV و MERS-CoV عى نطاق واسع، لا يزال البحث في SARS-CoV-2 في المراحل المبكرة. أظهر كل من SARS-CoV و - MERS CoV للتعبير عن البروتينات مع إمكانية التهرب من الاستجابات المناعية الفطرية المبكرة. ومع ذلك، لم يتم حتى الآن التحقق من قدرة - SARS CoV-2 عى استعداء الدفاعات المضادة للفيروسات داخل الخلايا. يمكن توضيح الإمراض الفيروسي والتدابير المضادة من خ ال الكشف عن كيفية تفاعل SARS-CoV-2 مع مناعة المضيف المضادة للفيروسات. سيتم عزل إجمالي RNA من عينات الدم لمرضى COVID-19 والمرضى الأصحاء. سيتم التشخيص عن التعبير الجيني المضاد للفيروسات لجينات الاستجابة المناعية الفطرية عن طريق استخدام PCR للاستجابة المضادة للفيروسات البشرية. سيتم إجراء التنميط المناعي للخلايا الأحادية والخلايا القاتلة الطبيعية والخلايا الليمفاوية ومجموعات فرعية مختلفة من الخلايا الليمفاوية باستخدام خلايا الدم من مرضى COVID-19 أثناء المرض النشط والشفاء بالاضافة الى مرضى الأصحاء. من المتوقع أن تقدم هذه الدراسة معلومات حول دور المناعة الفطرية والتكيفية في التسبب في الإصابة ب COVID-19 والحماية منها.

The ongoing coronavirus disease 2019 (COVID-19) pandemic is caused by severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2). SARS-CoV-2 is a member of Betacoronavirus genus that includes also the Severe Acute Respiratory Syndrome (SARS) and the Middle East Respiratory Syndrome (MERS) coronaviruses. While SARS-CoV and MERS-CoV have been studied extensively, research on SARS-CoV-2 is still in the early stages. Both SARS-CoV and MERS-CoV were shown to express proteins with the potential to evade early innate immune responses. However, the ability of SARSCoV- 2 to antagonise the intracellular antiviral defences has not yet been investigated. In this study, we aim to evaluate innate and adoptive immunity components to understand their role in the pathogenesis and protection against SARSCoV- 2 infection. Total RNA will be isolated from blood samples of laboratory confirmed COVID-19 patients and healthy subjects as non-infected controls. The antiviral gene expression of the innate immune response genes will be profiled by utilising the Human Antiviral Response PCR arrays. Immunophenotyping of monocytes, natural killer cells, lymphocytes, and different subsets of lymphocytes will be performed using peripheral blood mononuclear cells from COVID-19 positive patients during active disease and recovery, in addition to COVID-19 negative patients. This study is expected to provide information on the role of innate and adoptive immunity in the pathogenesis of and protection against COVID-19.